Ovi antimikrobni peptidi su izvorno izvedeni iz odbrambenih sistema insekata, sisara, vodozemaca, itd., i uglavnom uključuju četiri kategorije:
1. cekropin je prvobitno bio prisutan u imunoj limfi Cecropiamotha, koji se uglavnom nalazi u drugim insektima, a slični baktericidni peptidi nalaze se i u crijevima svinja.Obično ih karakteriše jako alkalni N-terminalni region praćen dugim hidrofobnim fragmentom.
2. Xenopus antimikrobni peptidi (magainin) su izvedeni iz mišića i želuca žaba.Utvrđeno je da je struktura antimikrobnih peptida xenopusa spiralna, posebno u hidrofobnim sredinama.Konfiguracija xenopus antipeptida u lipidnim slojevima proučavana je NMR-om u čvrstoj fazi.Na osnovu hemijskog pomeranja acilaminske rezonancije, spirale ksenopus antipeptida bile su paralelne dvoslojne površine i mogle su da konvergiraju da formiraju kavez od 13 mm sa periodičnom spiralnom strukturom od 30 mm.
3. Defensin Odbrambeni peptidi su izvedeni iz humanih polikariotskih neutrofilnih zečjih polimakrofaga s kompletnim nuklearnim lobulom i crijevnim stanicama životinja.Grupa antimikrobnih peptida sličnih odbrambenim peptidima sisara ekstrahirana je iz insekata, nazvanih “peptidi za odbranu od insekata”.Za razliku od odbrambenih peptida sisara, peptidi za odbranu od insekata aktivni su samo protiv gram-pozitivnih bakterija.Čak i peptidi za odbranu od insekata sadrže šest Cys ostataka, ali je način međusobnog vezivanja disulfida drugačiji.Način vezivanja intramolekularnog disulfidnog mosta antibakterijskih peptida ekstrahiranih iz Drosophila melanogast bio je sličan onom kod biljnih odbrambenih peptida.U kristalnim uslovima, odbrambeni peptidi su predstavljeni kao dimeri.
4. Tachyplesin je izveden iz rakova potkovice, zvanih potkovica.Studije konfiguracije pokazuju da usvaja antiparalelnu B-preklopnu konfiguraciju (3-8 pozicija, 11-16 pozicija), u kojojβ-ugao je spojen jedan s drugim (8-11 pozicija), a između 7 i 12 položaja, te između 3 i 16 položaja nastaju dvije disulfidne veze.U ovoj strukturi, hidrofobna aminokiselina se nalazi na jednoj strani ravni, a šest kationskih ostataka se pojavljuje na repu molekule, tako da je struktura i biofilna.
Iz toga slijedi da su gotovo svi antimikrobni peptidi katjonske prirode, iako se razlikuju po dužini i visini;Na visokom kraju, bilo u obliku alfa-zavojnice iliβ-sklopiva, bitropska struktura je zajednička karakteristika.
Vrijeme objave: Apr-20-2023