Postoji mnogo vrsta peptida prijemnih valova, a njihova klasifikacija temelji se na fizičkim i hemijskim svojstvima, izvorima, gutanjem mehanizama i biomedicinskim primjenama. Prema njihovim fizičkim i hemijskim svojstvima, membrana prodora peptidi mogu se podijeliti u tri vrste: kationski, amfifil i hidrofobični. Kationačka i amfifička membrana Prodirna peptida čine 85%, dok hidrofobna membrana prodire za peptide za samo 15%.
1. Kationska membrana prodorna peptida
Kationski peptidi za transmimembrane sastoji se od kratkih peptida boganih argininom, lizinom i histidinama, kao što su tat, penetratin, poliarginine, p22n, dpv3 i dpv6. Među njima, arginin sadrži Guanidin, koji može vodogene veze sa negativno nabijenim fosfornim kiselinama u membrani i medijalni peptidi za medijaciju u membranu pod uslovom fiziološke pH vrijednosti. Studije oligarginina (od 3 R na 12 R) pokazale su da je sposobnost prodove membrane postignuta samo kad je količina arginina bila toliko niža kao 8, a sposobnost prodiranja membrane postepeno se povećavalo povećanjem količine arginin. Lizin, iako kationski poput arginina, ne sadrži gunidin, pa kad postoji sam, njegova efikasnost prodora membrane nije baš velika. Futaki et al. (2001) utvrđeno je da se dobar efekt prodora membrane može postići samo kada je kationske ćelijske membrane prodor peptida sadržavao najmanje 8 pozitivno nabijenih aminokiselina. Iako su pozitivno napunjeni ostaci aminokiselina od suštinskog značaja za prodorne peptide da prodire u membranu, ostale aminokiseline su podjednako važne, poput kada se W14 mutira u F, prodornost penetratina.
Specijalna klasa kationskih peptida je nuklearna rezidencija (NLSS), koja se sastoji od kratkih peptida bogata argininom, lizinom i prolinom i mogu se prevoziti do jezgra kroz nuklearni pore. NLSS se može dalje podijeliti u pojedinačno i dvostruko kucanje, koji se sastoji od jednog i dva klastera osnovnih aminokiselina, respektivno. Na primjer, PKKKRKV iz Simian Virus 40 (SV40) je jedno upisivanje NLS-a, a nuklearni protein dvostruko kucanje NLS-a. KrpaatkKagqakkkl je kratak niz koji može igrati ulogu u membranskom transmembranima. Budući da većina NLSS-a ima punjenje manji od 8, NLSS nisu efikasni peptidi prijemnika, ali mogu biti efikasni peptidi za prijemne transmirani kada su kovalentno povezani sa hidrofobnim peptidnim sekvencima za obrascu amfiphiličnih peptida.
2. AMPHIPHILIČNI PENTEMBRANE PEPTIDE
Amphipilinski peptidni peptidi sastoje se od hidrofilnih i hidrofobnih domena, koji se mogu podijeliti u primarni amfifijski, sekundarni α-helicl amfifil, β-sklopivi amfiphilic i amfiphilic obogaćen prolin.
Primarna vrsta amfiphilića nose membranske peptide u dvije kategorije, kategorije sa NLSS-om Covalently Povezano hidrofobnim peptidnim sekvencom, poput MPG-a (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKVSTMGKKRKV), obje su zasnovani na nuklearnoj lokalnoj signali Domena MPG-a povezana je sa fuzijskim redoslijedom HIV glikoproteina 41 (Galflgflgaagstmg A), a hidrofobna domena PEP-1 povezana je sa bogatijim klasterom triptofana s visokim membranskim afinitetom (ketwwet wwtew). Međutim, hidrofobne domene obje su povezane sa nuklearnim signalizacijskim signalom PKKKRKV putem WSQP-a. Još jedna klasa primarnog amfifilanskih peptida izolirana je iz prirodnih proteina, poput PVEC-a, Arf (1-22) i BPRPR (1-28).
Sekundarni α-helicl amfifilni peptimidi veže se do membrane putem α-helikoptije, a njihove hidrofilne i hidrofobne ostatke aminokiselina nalaze se na različitim površinama spiralne strukture, poput mape (Klalklalk Alkaalla). Za beta peptid sepmična membrana, njegova sposobnost da se formira placeni list ključna je za njegovu sposobnost prodora membrane, kao što su u VT5 (dpkgdpkvtvtvtvtvtgkgdpkpdvtvtvtvtggdpkpd) u procesu prodorne sposobnosti membrane, koristeći analoge amino kiseline ne mogu oblikovati od presavijene Komad, sposobnost prodove membrane je vrlo loša. U prolini obogaćenim amfifilističkim peptimidima, poliprolin II (PPII) se lako formira u čistoj vodi kada je Prolin visoko obogaćen u polipeptidnom strukturu. PPI li je lijeva spirala sa 3,0 ostataka aminokiselina po okretanju, za razliku od standardne desne aphone-spiralne strukture sa 3,6 ostataka aminokiselina po okretanju. Prolin obogaćeni amfiphilički peptidi uključeni u goveni antimikrobni peptid 7 (BAC7), sintetički polipeptid (PPR) n (n može biti 3, 4, 5 i 6), itd.
3. Hidrofobna membrana prodorna peptida
Hidrofobni peptidni peptidi sadrže samo ne-polarnim ostacima aminokiselina, s neto naplatom manjim od 20% ukupnog naboja aminokiseline nizova ili sadrže hidrofobne mozgove ili hemijske grupe koje su bitne za prijenosnu grešku. Iako se ovi ćelijski peptidi prenemetrana često zanemaruju, oni postoje, kao što su faktor rasta fibroblasta (K-FGF) i faktor rasta fibroblasta 12 (F-GF12) iz Kaposi-ovog Sarcome.
Vrijeme objavljivanja: 2025-07-01